使用aspera下载组学数据

news/2024/7/5 3:35:49

1. 安装

# 使用conda安装
conda install -c hcc aspera-cli

# 测试是否安装成功
ascp -h

2. 蛋白组学

用例1. 从iprox下载蛋白组

ascp -d -v -QT -l100m -P 33001 --file-manifest=text -k 2 -o Overwrite=diff user@download.iprox.org:/pid /path
  # user替换成自己注册的账户名
  #pid替换成下载的项目
  #path替换成本地存放路径

用例2. 从PX下载蛋白组

ascp -TQ -P33001 -l 100M -i /path/miniconda3/etc/asperaweb_id_dsa.openssh prd_ascp@fasp.ebi.ac.uk:/pride/data/archive/yy/mm/pid /path

Ascp Command Reference


http://lihuaxi.xjx100.cn/news/1719381.html

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